ראשית, הכן את כל הכלים ואספקת החירום לפני ההפעלה. כמו מיכלי אמוניה או מספר מסוים של בקבוקי אמוניה, מאזניים, צינורות חיבור, כלי מתקנים, מסכות גז, כפפות גומי ותרופות עזרה ראשונה. לאחר מכן כוונו את השסתומים הרלוונטיים של המערכת, סגרו את שסתומי אספקת הנוזל לציוד בלחץ נמוך ולמאייד, והפעילו את המדחס לשאיבת האמוניה ממערכת הלחץ הנמוך אל המעבה ומאגר הלחץ הגבוה. הנח את בקבוק האמוניה על המשקל, והשתמש בצינור גומי בלחץ גבוה (עם לחץ של יותר מ-3MPa) כדי לחבר את בקבוק האמוניה הריק לצינור הזרמת אמוניה של תחנת התדלוק באמוניה. החיבור צריך להיות איתן. פתחו מעט את שסתום פריקת האמוניה בתחנת תדלוק האמוניה, ובדקו את אטימות צינור פריקת האמוניה והחיבורים. פתח את שסתום הפחתת הלחץ בתחנת תדלוק האמוניה כדי להפחית את הלחץ של מיכל האמוניה או בקבוק האמוניה, ולאחר מכן סגור את שסתום הפחתת הלחץ ופתח את שסתום שחרור האמוניה כדי לפרוק אמוניה לתוך בקבוק האמוניה או מיכל האמוניה.
שנית, נשקל מיכל האמוניה שהוציא את האמוניה. בדרך כלל, זה לא יעלה על 60% מהקיבולת שלו. כאשר מתווספת הכמות הנדרשת, יש לסגור את שסתום גליל האמוניה ואת שסתום הנוזל בתחנת תדלוק אמוניה בזמן, לפתוח את שסתום הפחתת הלחץ בתחנת התדלוק באמוניה, לפנות את הנוזל בצינור האמוניה, לסגור את שסתום הפחתת הלחץ, וכן הסר לאט את הגליל חבר את הצינור והחלף אותו בבקבוק חדש. כאשר מיכל האמוניה מגיע לכמות יש לסגור תחילה את שסתום מיכל האמוניה, לפתוח את שסתום הפחתת הלחץ בתחנת התדלוק באמוניה ולאחר ניקוז נוזל האמוניה בצינור, לסגור את שסתום הפחתת הלחץ ולהוציא את הצינור המחבר. אם לחץ היניקה של מדחס הקירור נמוך מדי, ניתן לפתוח את דלת אחסון הקיר להגברת טמפרטורת האחסון ואידוי האמוניה. ניתן להגביר את לחץ היניקה של המכונה, ולשאוב את מערכת הלחץ הנמוך ל-0.05MPa (מד לחץ). לאחר עצירה, אם הלחץ עולה, ניתן להפעיל אותו מחדש כדי לשאוב למטה. על מנת להקל על עיבוי האמוניה, ניתן להעלות את לחץ העיבוי, למשל, ניתן לשלוט בו בין 1.3-1.4 MPa (מד לחץ).
לבסוף, מפלס הנוזל במאגר הלחץ הגבוה יורד מתחת ל-5%. כאשר נוזל האמוניה אינו יכול להיכנס לגליל האמוניה או למיכל האמוניה, והלחץ של מערכת הלחץ הנמוך עולה מתחת ל-0MPa (מד לחץ), ניתן לראות בכך סיום נטילת האמוניה. את הכמות הקטנה הנותרת של אמוניה אפשר לשים בדלי עם מים או בבריכת מעבה.
בנוסף לשיטות הנ"ל, כאשר לא ניתן להפיק נוזל קירור אמוניה עקב המאפיינים המבניים של המדחס (כגון סוג סגור למחצה או סגור לחלוטין), יש להשתמש במדחס קירור אחר שיסייע במשימת שאיבת הקירור.
